サイトを作成しているとよくあることですが、
などと。
Joomla!は、メニューにテンプレートを割り当てる事ができるのでメニュー毎にテンプレートを切り替える方法は、一般的な方法です。
もう一つ簡単な方法として考えられること。要はその表示・非表示の条件が、何で判断できるかを考えてみます。
例えば、
<?php if($this->countModules('作成したモジュールのモジュールポジション')) : ?>
<jdoc:include type="modules" name="ログイン後に表示したいモジュールポジション" style="rounded" />
<?php endif; ?>