ページのソースを表示してdescription部分を見るとそのページで開いている最後(一番下)の記事のdescriptionが、最初に表示される。これは、Joomla!のヘッドタグに追加するメソッドが後からの分を登録済みのものの前に追加するように書かれているからです。
そこで変更してみました。
Root/includes/joomla.php
$this->_head['meta'][$i][1] = $content . ', ' . $this->_head['meta'][$i][1];
を
$this->_head['meta'][$i][1] = $this->_head['meta'][$i][1]. ', '. $content;
として後から追加されるものは登録済みのものの後に追加するようにしてみました。これで最新のものが先に来るはずです。というより並び順の最初のものと言った方が良いのかな。
と、Joomla!1.5はどうかと気になったので確認してみましたが、記事単体を表示した状態でないとdescriptionに反映されない? ブログレイアウトのように複数の記事の場合は、サイトのdescriptionのみが表示されるようですね。